設定アプリ（歯車アイコン） → 下の方のInstagramアイコン → カメラロールへの保存 → 元のフォトを保存する、フィルタ済み写真を保存 をそれぞれオン
そういえば設定アプリの中にもInstagramの設定するところあったの思い出しました。これは盲点でした。
お気に入りのフォトアプリInstagramのメジャーバージョンアップ。フィルターが増えたり、地味なところでは写真の回転ができるようになったのもうれしい。でも撮影後、その写真がカメラロールに保存されなくなって残念に思っていたとこでした。
「Instagram 2.0」登場 – 待望の高画質対応、フィルターが200倍高速に | 携帯 | マイコミジャーナル
これでちゃんとエフェクト前の写真も、その後の写真もカメラロールに保存されますよー！
もうひとつの最大のバグ、写真が真っ黒になってしまうのは次のバージョンで解決だとか。AppStoreには提出したので近々リリースだそうです。
Instagram • v2.1 Submitted to the App Store